Під час первинного аудиту проводиться загальний аналіз господарства, а саме:

• Відбувається знайомство з керівником та головними спеціалістами господарства
• Оцінюється розмір та спеціалізація господарства
• Визначається кількість основних та тимчасових працівників
• Вивчається стан документації та ведення діловодства
• Досліджуються особливості систем живлення та захисту рослин
• Вивчаються ґрунти та особливості рельєфу полів господарства, тощо

На підставі цього визначається період, необхідний для приведення господарства у відповідність до вимог стандарту, а також розробляється план дій по запровадженню в господарстві системи GlobalGAP.